Για την υλοποίηση του έργου θα χρησιμοποιηθούν σύγχρονες πρακτικές διαχείρισης των εκτροφών και θα πραγματοποιηθούν στοχευμένες παρεμβάσεις, με στόχο τη βελτίωση τόσο των συνθηκών υγιεινής και της ευζωίας των εκτρεφόμενων ζώων, όσο και της ποιότητας των παραγόμενων κτηνοτροφικών προϊόντων.

  Παράλληλα, θα εφαρμοσθούν σύγχρονες τεχνικές γονιδιακής τεχνολογίας και μοριακής βιολογίας. Συγκεκριμένα, θα πραγματοποιηθεί απομόνωση DNA από μεγάλο αριθμό ζώων των ελληνικών φυλών και θα δημιουργηθούν τράπεζες διατήρησης γενετικού υλικού (DNA), οι οποίες θα αποθηκευτούν σε συνθήκες μακράς κατάψυξης στους -80°C. Οι τράπεζες αυτές θα χρησιμοποιηθούν σε προγράμματα γενετικής βελτίωσης για τη βελτίωση τόσο των ποσοτικών, όσο και των ποιοτικών χαρακτηριστικών των ζώων των ελληνικών φυλών. Με τη χρησιμοποίηση των τεχνικών της απομόνωσης γονιδίων, μέσω της αλυσιδωτής αντίδρασης της πολυμεράσης (PCR), του εντοπισμού πολυμορφισμών γονιδίων, μέσω της τεχνικής του πολυμορφισμού μήκους τεμαχίων περιορισμού (RFLP) και της ηλεκτροφόρησης νουκλεϊνικών οξέων, θα εντοπιστούν λειτουργικοί μοριακοί δείκτες.

  Στα πλαίσια του έργου θα πραγματοποιηθεί επίσης εκτεταμένη πρωτογενής έρευνα των κτηνοτροφικών εκμεταλλεύσεων για την τεχνικοοικονομική ανάλυση των κλάδων ζωικής παραγωγής, για την εκτίμηση της οικονομικότητας των εκτροφών και του κόστους παραγωγής των κτηνοτροφικών προϊόντων, με στόχο την επισήμανση των αδυναμιών τους.

  Τέλος, καθώς σε παγκόσμιο επίπεδο η έρευνα για τον εντοπισμό λειτουργικών μοριακών δεικτών βρίσκεται σε εξέλιξη, οι τράπεζες διατήρησης γενετικού υλικού των φυλών που θα δημιουργηθούν, θα μπορούν να χρησιμοποιηθούν στο μέλλον για τον εντοπισμό και χρήση των νέων δεικτών που θα ανακαλυφθούν στις ελληνικές φυλές.