To Επιχειρησιακό Σχέδιο περιλαμβάνει στις ακόλουθες ενότητες εργασίας (Ε.Ε.) και παραδοτέα εργασιών (Π.Ε.):

1. Βελτίωση συνθηκών υγιεινής και ευζωίας
   • Ε.Ε.1: Καταγραφή των κυριότερων ζωοτεχνικών παραμέτρων και εφαρμογή σύγχρονες πρακτικές διαχείρισης.
   • Π.Ε.1: Έκθεση για την υφιστάμενη κατάσταση και τις σύγχρονες πρακτικές διαχείρισης.
2. Δημιουργία τραπεζών γενετικού υλικού
   • Ε.Ε.2: Απομόνωση DNA και δημιουργία τραπεζών DNA.
   • Π.Ε.2: Τράπεζες DNA των ελληνικών φυλών.
3. Δημιουργία βάσης δεδομένων και γενοτυπικές αναλύσεις
   • Ε.Ε.3: Εντοπισμός αλληλόμορφων γονδίων και οι γενότυποι των ζώων.
   • Π.Ε.3: Γενετική βάση δεδομένων των ελληνικών φυλών.
4. Δημιουργία σχεδίου οικονομικής διαχείρισης των φυλών
   1. Ε.Ε.4: Πραγματοποίηση τεχνικοοικονομικής ανάλυσης των εκτροφών.
   2. Π.Ε.4: Αναλυτική έκθεση σχεδίου οικονομικής διαχείρισης των φυλών.
5. Επιμόρφωση παραγωγών
   
   • Ε.Ε.5: Πραγματοποίηση δράσεις επιμόρφωσης παραγωγών.
   • Π.Ε.5: Συναντήσεις επιμόρφωσης παραγωγών.
6. Διάχυση των αποτελεσμάτων
   • Ε.Ε.6: Ενημερωτικό υλικό, συμμετοχή σε συνέδρια και ημερίδες, δημιουργία ιστοσελίδας.
   • Π.Ε.6: Ενημερωτικά φυλλάδια, ιστοσελίδα, ημερίδες.